亿万先生MR以习近平新时期中国特色社会主义思想为领导 ，以立德树报答底子 ，落实教育部“一站式”学生社区综合治理鼎新要求 ，夯实“三全育人” ，践行钱伟长教育思想 ，全面推动书院建设。2022年9月 ，学堂成立伟长书院、秋白书院、宏嘉书院、青云书院、泮池书院、文荟书院、日新书院、闳约书院、自强书院、尚理书院、溯微书院、丝路书院共12家本科生书院 ，覆盖全学段本科生人才造就。
亿万先生MR尝试专业学院建书院、“双院”协同育人的人才造就模式 ，将优质育人资源压切实“一线” ，各书院结合学科专业特点发展课表造就活动 ，形成特色鲜明的书院文化 ，推进学生全面发展 ，提升学生创新能力；学堂选派百千导师进书院 ，打造有利于师生互动 ，温馨和谐的育人治理服务环境 ，形成“交以为师”的师生关系；书院尝试学生“四自治理” ，体现学生主体性 ，着力造就学生主人翁意识 ，引领新时期青年自主成长。
亿万先生MR本科生书院以价值引领、人格养成、能力提升为主题 ，以造就德智体美劳全面发展的卓越创新人才和堪当民族回复大任的时期栋梁为使命 ，与学分造、选课造、短学期造和本科生全程导师造相融相促 ，致力建设成为拥有中国风格、国内一流、亿万先生MR特色的人才造就系统。
